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- 发布日期：2023-05-25 10:52 点击次数：149
专家好 今天共享一篇今小编跟专家共享一篇免疫分型的著述，著述题目是Atranscriptomic pan-cancer signature for survival prognostication and prediction of immunotherapy response based onendothelial senescence（基于内皮细胞病弱的转录组泛癌秀丽用于糊口展望和免疫调整反馈展望）美国特黄色片久久，这篇著述于发表在J Biomed Sci上，底下咱们跟班文件解读进行进一步学习。
日本共同社报道，拜登已经批准训练乌克兰飞行员。泽连斯基称：“这是美国的一个“历史性决定”。同时，还在继续寻求西方国家的军事支持，以击退俄军。”
中韩经贸的形势转变是多方面因素综合的结果，其中一大原因在于，韩方对形势发生了误判，以牺牲对华关系作为发展对美关系的牺牲品。韩方在涉华问题上的错误做法体现在三方面，外交层面，韩方迎合美国，单边恶化来之不易的中韩互信。韩方一度以新冠疫情为由，对中国入境旅客采取歧视做法，对美日等国旅客入境不做限制，单单对中国旅客进行挂黄牌、单独通道、军人对接等方式。事件引发中方对等反制后韩方才予以撤销，但相关做法是对韩国旅游业的自砸招牌，引发的中国消费者对韩观感恶化涟漪至今仍在发酵。另一方面，韩国国会副议长此前窜访中国台湾岛，韩国总统访美前，发表涉台错误言论向美国缴纳投名状。韩方做法，引发中韩互信受创，在自我封堵韩国商品销往中国市场之门。
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究诘布景微血管内皮固有地截止恶性肿瘤的养分运输、氧气供应和免疫监测，因此代表了癌症的生物学先决要求和调整脆弱性。
最近，细胞病弱练为实体恶性肿瘤的基本特征。特别是，据报谈肿瘤内皮细胞得到病弱相干的分泌表型，其特征在于促炎转录格局，最终促进肿瘤孕育和远方同样的变成。
因此，咱们假定肿瘤内皮细胞（TEC）的病弱代表了精确肿瘤学中糊口预后和免疫调整疗效展望的有但愿的靶点。
究诘效果
见图一
评估肿瘤环境中单个细胞类型的病弱状况。
图一
调治流形雷同和投影 （UMAP） 图流露了来自不同肿瘤实体的 5 个 scRNAseq 数据集的簇和簇细胞类型堤防的集成数据集（A-E，左）。
特征图流露了每个细胞的病弱相干基因集的假样貌富集（A-E，中）。脊图（A-E，右）流露了病弱评分在细胞簇中的散播;CAF癌症相干成纤维细胞，TEC肿瘤内皮细胞，HPC肝祖细胞。
见图二
通过泛癌scRNAseq分析开发肿瘤内皮细胞特异性病弱相干转录组学特征。
图二
A 马戏团图流露了EC的生成过程。病弱。西格。
B（左）EC的路线富集分析。病弱。SIG基因。前 10 个丰富的 GO 项和反馈组路线流露在条形图中。
B（右）Cnet图流露了来自这些信号通路的特定基因网罗。
见图三
EC的泛癌分析。病弱。西格。高EC和低EC肿瘤组织之间几种肿瘤促进路线的富集分析。
图三
A 病弱。TCGA部队中33种癌症类型的SIG评分，GSEA算法中的NES标准化富集评分，FDR空虚发现率。
B 欧共体之间关系选录。病弱。TCGA泛癌症部队中33种癌症类型患者的SIG评分和OS / PFS。流露了与预后较差（黄色）或预后较好（蓝色）相干的基因的抒发。
C EC的相干性。病弱。流露了TCGA部队中33种癌症类型的SIG评分和免疫浸润（Cibersort），蓝点示意负相干，红点示意正相干。
见图四
使用EC展望抗PD-L1 / PD-1免疫调整的效果。SENESCENCE.SIG. EC的相干性。
图四
A 病弱。泛癌TCGA部队中每个癌症实体的SIG评分和TMB。
B C EC的各别。病弱。扞拒PD-L1/PD-1免疫调整有不同反馈的患者的TEC的SIG评分，流露p值。
D 描摹基于机器学习算法的免疫调整反馈展望模子构建的经过图。
E 多秉承器使命特征 （ROC） 图，流露考证鸠集不同机器学习算法的性能。
F ROC 图示意最终 EC 的性能。病弱。考证鸠集的 SIG 模子。
G 热图和 H 马戏团图流露了 EC 性能之间的比拟。病弱。SIG模子和先前发表的泛癌症模子在不同检测组上扞拒PD-L1 / PD-1免疫疗法的反馈。
见图五
EC的预后领略。病弱。TCGA中的SIG相干泛癌模子。
图五
A，B Kaplan-Meier分析流露了TCGA泛癌症稽察和测试鸠集患者的风险评分与OS之间的关联。
C 欧共体的辨认。病弱。流露了TCGA泛癌症部队中不同肿瘤分期之间的SIG相干风险评分。
D EC的相干性。病弱。流露了 TCGA 部队中 33 种癌症类型的 SIG 相干风险评分和几种肿瘤促进路线的富集。蓝点示意负相干，红点示意正相干。
E-J EC之间的关联。病弱。流露了多种肿瘤患者的SIG相干风险评分和OS，BRCA乳腺癌，CESC宫颈癌，HNSC头颈癌，KIRC肾透明细胞癌，LIHC肝癌，PAAD胰腺癌。
见图六
EC的预后领略。病弱。外军部队中的 SIG 相干泛癌症模子。
图六
A-I Kaplan-Meier分析外军部队中患者的风险评分与OS之间的相干性，给出了p值。
中广加中国胶质瘤基因组图谱、乳腺癌外洋定约METABRIC分子分类法、BLCA膀胱癌、结直肠癌结肠癌、LUAD肺腺癌、LUSC肺鳞状细胞癌、OV卵巢癌、PRAD前方腺癌。
见图七
EC的灵验性评估。病弱。SIG繁衍的列线图特征在展望泛癌预后中的诳骗。
图七
A 流露了用于展望TCGA泛癌症部队中患者总糊口期的列线图。
B 流露了咱们的模子的校准，以确保展望和本色糊口之间的一致性，45度线代表齐备的展望。
C 泛癌TCGA稽察和测试鸠集不同癌症类型的列线图分数的单变量Cox分析。
D 时刻依赖性 ROC 弧线流露 EC 的预后领略。病弱。泛癌TCGA稽察和测试鸠集的SIG相干评分和列线图评分。E 随时刻变化的 ROC 弧线流露 EC 的预后领略。病弱。外军部队中的 SIG 相干分数和列线图分数。F 这<>个部队列线图评分预后领略的meta分析。
究诘论断
当作调整角度，基于EC构建的机器学习模子。病弱，SIG为免疫调整反馈提供了优于先前发表的转录组学模子的泛癌展望，咱们在这里拓荒了基于内皮病弱的糊口预后和免疫调整反馈展望的泛癌症转录组学特征。
好了 今天的文件解读就到这儿来美国特黄色片久久，咱们下期再会！
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